역사과는 1950년 6·25 남북전쟁으로 엄청난 타격을 입었다. 이능식 교수가 교육시찰단 명의로 북행하게 된 후 귀환을 못하고, 부산피난시절 손보기 교수가 연구차 도미(渡美) 후 학과를 떠났다. 학생들 상당수는 학도병에 투입되어, 수학생은 매우 적었다. 그러나 역사과의 교수진과 학생들은 학문 연구와 역사 교육에 매진하였다. 이 중에서 김성근교수는 학과를 이끌어 나가면서 서양의 전반 사조의 발전과 중요한 사실의 대강을 강론한 『서양사개론』을, 6·25 남북전쟁 직전인 1950년 이른 봄에 시작하여 피난 시절의 악전고투 끝에 휴전 직후인 1953년 10월에 출간하였다. 그것은 재래의 일본적 서양사관과 서술 방식에 근본적인 수정을 가하려는 시도였다.
 
   한편, 김성근 교수는 역사교육에도 지대한 관심을 보이며 통합사회의 문제점을 지적하였다. 우선 역사, 지리, 공민 등 3학과 폐합의 정당성과 가능성이 충분히 논의되지 않았다는 것이다. 더욱이 이는 세계적인 미해결의 문제임을 강조하였다. 즉 통합사회과가 세계 각국에서 적용되는 예는 많지 않은 반면에 계통적인 국민사가 많으며 역사과가 독립교과로 존재하고 있음을 역설하였다. 그리하여 역사교과의 강화를 다음과 같이 주장하였다. 첫째, 국민의식의 확립을 들고 있다. 이는 국가주의가 아니라 현하의 위기를 극복하는 차원에서 민족적 공동운명의식과 운영 연대 의식을 내실로 하고 있어 역사적인 이해와 성찰을 도외하고는 파악할 수 없다고 본 것이다. 둘째, 후진성의 극복을 강조하면서 세계사적 통찰과 우리의 역사적 현실에 대한 엄정한 자기비판에서 출발해야 하며 이것이 역사교육이 담당해야 할 주요한 임무라고 주장하였다. 즉 주체성의 확립과 국제정치 및 사회에 대한 객관적인 이해와 서방문화의 본질에 대한 이해가 필요하다는 것이다. 김교수의 역사교육에 대한 이러한 자세와 열정은 훗날 역사교육연구회의 창립과 역사교육연구의 초석을 세우는 계기가 되었다. 그는 교사로서 갖추어야 할 학문적 소양을 강조하면서 사범대학의 교사양성 방향을 제시하였다. 학문과 교육은 대상·목적의 차이에서 각각의 중점을 달리 둘 뿐, 상호 분리되지 않고 일체를 구성하고 있으며 사범교육은 이러한 일체에 입각하고 있다는 것이다.
 
   다음 1952년 6월에 취임한 경성제대 출신 채희순(蔡羲順, 동양사, 1907. 5~1986.12)은 동양사 사료 강독, 중국정치, 교육제도사 등을 강의하면서 1954년에 이전의 『동양사개론』(1949)을 보완하여 출간하였다. 그는 서문에서 동양문화의 우수성을 강조 천명하여 악랄한 제국주의의 지독한 속박에서 해탈하여 자주적인 국가를 회복하고 약소민족의 오명을 벗어날 수 있게 되기를 고대하고 있음을 밝히고 있다. 1956년 4월에 부임한 변태섭(국사)은 최초 본과 출신 교수로 고대사와 고려사 연구에 혁혁한 성과를 남겼다(『高麗政治制度史硏究』, 『高麗史硏究』). 특히 그는 만적의 난과 무신란 연구 등 고려시기 정치 변동에 대한 연구를 시발로 고려 시기 정치제도사 연구를 본격화함으로써 고려시기의 역사를 발전적인 안목에서 체계화하려고 하였다. 이러한 연구 방향과 방법은 역사학에 중심을 두면서도 늘 역사교육의 제반 문제들 즉 학생들의 역사 이해를 체계화하려는 시도와 맥을 같이 하는 데서 비롯되었다. 1959년 3월 손보기교수의 후임으로 부임한 김용섭(金容燮, 국사)은 조선시대사 및 근대사, 사회경제사, 사학사 강좌를 담당하면서 진주민란, 동학란 등 민족내에서의 계급적 대립 문제에 대한 연구를 계기로 조선후기의 농업, 농업문제에 천착함으써 사회 발전의 안목에서 실증적인 연구를 통해 한국사를 체계화할 수 있는 토대를 구축하였다(『朝鮮後期農業史硏究』, 『韓國近代農業史硏究』, 『韓國近現代農業史硏究』, 『朝鮮後期農學史硏究』, 『韓國中世農業史硏究』). 이는 타율성과 정체성으로 점철된 제국주의 사관의 극복을 의미하기도 하였다. 이처럼 그는 정통 역사학의 자세와 실천을 사회경제사학으로 구현하여 학과는 물론 학계에 거대한 전환을 가져오게 하였다.
 
   5·16 군사 쿠데타로 사범대학이 위기를 맞던 시절을 지나 1966년 3월에 부임한 이민호(李敏鎬, 서양사)는 서양근대사, 사학사, 사학개론 등을 주로 강의하면서 우리나라에서 독일근대의 사회경제연구를 개척하고, 역사이론, 소시민층에 관한 소중한 성과를 내었다(『近代獨逸史硏究』, 『近代獨逸社會와 小市民層』). 1967년 7월 김용섭 교수가 문리대로 옮겨간 뒤 후임으로 취임한 이원순(李元淳, 국사)은 연행사행 연구를 시발로 역사의 국제 계기에 중점을 두고 서학을 본격적으로 연구하기 시작하였다. 이는 역사학의 입장에서 그리스도교 신앙과 한국교회의 문제를 다룬 것이었다(『韓國西學史硏究』, 『韓國天主敎會史硏究』, 『朝鮮時代史論集』). 특히 이원순 교수는 역사교육 연구에 매진하여 역사학과 역사교과의 거리를 좁혔으며 우리 나라 최초로 역사교육론을 저술하였다. 그리하여 훗날 우리나라에서 전문적인 역사교육 연구자가 나올 수 있는 토양을 조성하였다.
 
   또한 역사과는 1968년 7·8월 경기도 암사리 신석기 유적을 발굴 정리하고 향토사자료실을 개설하였다. 이는 원시 고대사 및 향토사의 연구 및 교육의 기반을 마련하는 계기가 되었다. 특히 이런 작업이 학과 창설 이래로 매년 봄가을로 수행되어온 학술고적답사와 매우 밀접하다는 점에서 교수와 학생들의 학구열을 배가시킬 수 있었으며 나아가 역사학과 역사교과를 연계하는 작업을 본격화할 수 있었다.
 
   다음 역사과 교수들은 현장 교사들과 더불어 역사교육연구회 운영에 주도적인 역할을 수행하였다. 역사과 출신 대학교수 및 현직 중등교사들을 중심으로 열악한 조건에도 불구하고 역사교육의 주체적인 자세와 방법론의 체계화를 통해 우리나라 역사교육의 정상화를 꾀했다. 그리하여 역사교육연구회는 초창기에는 연간지로 『역사교육(歷史敎育)』을 발행하였고 현재는 계간지로 발간하여 역사교육연구의 활성화에 이바지하고 있다. 이 학회지에는 두 가지의 조류가 흐르고 있었다. 하나는 기존 역사학계에 드리워져 있는 식민사관의 극복 문제와 관련되어 국사 연구 및 국사교육에 대한 반성과 비판이다. 또 하나는 역사교육의 체계화에 초점을 두고 방법론 문제에 대한 탐구이다. 이러한 두 조류는 역사학과 역사교육을 불가분의 일체로 파악한 가운데 연구와 교습의 비중 여하, 학문과 교습의 중점 여하에 나오는 경향이었다. 그리하여 이 두 조류는 상보적인 관계에서 상호 발전의 계기로 작용하였다. 현재 『역사교육』지는 우리나라 역사학·역사교육 관련 학회지에서 『역사학보』지 다음으로 가장 오랜 역사와 전통을 가지고 있다.
 
   그러나 역사과는 1975년 서울대학교 종합화와 관악교정 이전으로 난국과 시련을 다시 맞이하였다. 우선 과 교수 4인 중에서 3인이 인문대학으로 이적함으로써 강좌를 운영할 수 있는 교수 인원이 절대 부족이었다. 이원순 교수가 4년 가까이 홀로 과를 운영하였다. 이는 연구와 교육의 파행, 학생 지도의 낭패로 나타났고, 이러한 현상은 사범대학 공통의 현상이기도 하였다. 그리하여 해당 학과들을 중심으로 사범대학의 정비 요구가 비등하였으며 그 결과 역사과는 1979년 3월 윤세철(尹世哲, 역사교육 및 동양사), 허승일(許勝一, 서양사)이 함께 신임교수로 부임하여 안정과 활력의 전기를 맞았다. 윤세철 교수는 중국 국민혁명 연구를 통해 중국 근대화의 방향과 특질을 규명하는 한편 역사교육의 이론과 실제에서 괄목할 만한 성과를 제시하였다. 특히 세계사교육 연구의 방향과 방법론 탐구에 노력하여 이 방면에 관심을 환기시켰다. 허교수는 로마사 연구와 서양고대사를 강의하는 한편 로마사 및 서양고대사 연구 방면에서 지평을 넓혔다(『로마공화정연구』, 『로마사입문』, 『로마제정사』). 이어 1985년 3월에 李景植(국사)이 신임하여 전임교수는 넷이 되었다. 이교수는 조선시기의 토지 농업연구를 중심으로 그 동안 결여되어 있던 사회경제사 계열의 강의를 보충하였다(『朝鮮前期土地制度硏究』, 『朝鮮前期土地制度硏究』Ⅱ, 『韓國 古代 中世初期 土地制度硏究』, 『韓國中世土地制度史硏究』).

   과 교수진이 정비됨과 함께 역사학과 역사교육의 연계, 그 이론 모색 및 유용 방식의 탐구 등이 부각되었다. 역사교육계열 강좌의 보강과 1980년 과 교수가 공동 집필한 『역사교육론』의 출간은 그 표현이었다. 1986년도에 신입생을 선발한 대학원 박사과정의 설치도 그 계기로서 1993년 8월부터 학위논문이 나오고 있다. 그간 역사교사 및 학자의 배출에 더하여 역사교과학의 전문가도 양성하게 되었다(2016년 8월 현재 박사학위 수여자 22명). 이에 교수 요원이 하나 더 증원되어 1989년 3월 김광수(金光洙, 국사)가 부임하였다. 김광수 교수는 우리 역사의 시초부터 민족의 기원 형성 및 국가 성립 문제를 계기적이고 발전적으로 제시하고 고려의 신분 관제 및 사학사 연구를 통해 우리 고중세사의 새로운 체제를 해명하는 한편 역사교재 및 그 연구법의 개발에 대해 심도있는 방향을 제시하였다. 1991년 8월 이원순 교수가 정년 퇴임하고 1992년 3월 양호환(梁豪煥, 역사교육 및 서양사)이 후임하였다. 양호환 교수는 역사의 교수 학습에 관한 평가 및 방법 등을 연구하여 역사교과학의 학문성 및 전문성을 모색하고 있다. 2000년대에 들어와 윤세철, 김광수, 허승일 교수가 차례로 정년 퇴임한 뒤 유용태(柳鏞泰, 동양근현대사 및 역사교육), 김태웅(金泰雄, 한국근현대사 및 역사교육), 김덕수(金悳洙, 서양고대사 및 역사교육) 교수가 2002년, 2004년, 2006년에 신임하였다. 2007년에는 서의식(徐毅植, 한국고대사 및 역사교육) 교수가 부임하였고, 2013년에는 이경식 교수가 정년퇴임하고 이어 박평식(朴平植, 한국중근세사 및 역사교육) 교수가 착임하였다. 2021년과 2022년에는 서의식, 유용태 교수가 차례로 정년 퇴임하였고, 2022년 9월에 최재영(崔宰榮, 중국고중세사 및 역사교육), 김성현(金聖玹, 한국고대사 및 역사교육) 교수가 부임하였다. 2023년에는 양호환 교수가 정년 퇴임한 뒤 이미미(李美薇, 역사교육) 교수가 착임하였다.